Super Motherload est un jeu de pose de tuile/deckbuilding, ce qui signifie que vous avez votre propre jeu de cartes à partir de laquelle vous piochez chaque tour. Les cartes dans votre deck commencent en étant très basiques, mais au cours du jeu, vous ajouterez de nouvelles cartes plus puissantes. Vous pouvez utiliser ces cartes pour exploser la roche et pour percer les minéraux à jour et avoir d'autres bonus du plateau de jeu. Vous utilisez ensuite les minéraux que vous avez recueillis comme de l'argent pour acheter de meilleures cartes pour votre deck. Certaines cartes vous donnent un bonus immédiat quand vous les achetez, et certaines vous donnent d'autres bonus lorsque vous les utilisez afin de percer la terre. Chaque carte que vous achetez vaut des points de victoire (PV). Vous pouvez aussi gagner des PV à partir de cartes d'objectifs qui seront disponibles tout au long de la partie. Celui qui a le plus de points de victoire à la fin de la partie gagne.

Super Motherload dispose de plateaux de jeu qui sont ajoutés et supprimés pendant le jeu pour créer un effet de défilement actif comme dans les jeux vidéo, et il remet en question les compétences spatiales de 2-4 joueurs qui aiment les jeux vidéo, l'Eurostyle dans les jeux de société ou les jeux de deckbuilding.